菊花石开采加工的历史有近三百余年，在不同的时期，不同的石料所设计雕刻的样式与新旧程度都不一样，因此不同的年代的菊花石雕作品其收藏价值也有区别。作品的年代越久，它所蕴藏的历史文化内涵也越珍贵，珍贵的程度往往会超过作品本身的雕刻价值。一般情况下，在时代、石材相同的前提下，有工的价值肯定要超过素面的很多。
菊花石雕工是一个时代审美理想、艺术趣味和工艺水平的体现，它不仅可见出工艺师的才能与智慧，而且可以看到他们为之付出的辛勤劳动。凡是有创意，艺术张力强劲，或内容独特，讨口彩，为喜庆吉祥图案的，价值就高。
做工越是精细，所下功夫也越深，越费时费力，价值自然也越高。除了质地、花形、雕工三个要素外，菊花石雕作品尺寸的大小、品相的好坏也是评判作品价值高低的标准。一般来说，在质地、花形、雕工相同的前提下，尺寸大的总是比尺寸小的价值高；品相好、完整无缺的总是比品相差、有残缺的价值高。有些菊花石雕作品， 石料雕工相当不错，似有绺裂，或有残缺，未免让人感到遗憾。残缺部位虽然可以通过雕工掩饰，但行家一眼便能看出。尺寸大小很容易判断，品相好坏要仔细鉴别，因为它往往被巧妙的雕刻掩饰掉，这需要多学习多看多实践。